赵坤元乃道：“陛下殉难动静还要一些光阴方至南京，不到当时太子殿下暂不露面，免受非议。只暗中先将继位忠贞之士，悄悄带到此处君臣见上一面，提早筹办。”
马上传书四方，命门人弟子，齐聚扬州，又广邀同道前来助拳。这才有了一番三教斗法扬州城的后话。
穆函过来禀报，问道接下来如何措置？赵坤元叫他莫急，道：“先前已令你徒弟陪着万妙仙姑来此安插，且等上半晌，自有计算！”乃焚了一道传音符咒，召许飞娘与火有害前来汇合。
太子朱慈?r见状也同求削发修道，为赵坤元婉拒，一面劝道：“殿下乃是万民所仰，现在神州涂炭，亟需殿下顺天应人，即位继位。诸多人间人缘岂能丢弃，国仇家恨岂可忘怀？殿下乃是大明复兴之主，天然有神灵庇佑，英杰效命，何必本身亲身修行？”
本来南明因为弘光帝得位不正，难服众望，诸多宗室各怀鬼胎，争权夺位；藩镇悍将，拥兵自重，各自为战，故而虽有百万军兵，难于协同，为满清一一攻破。现在太子朱慈?r名正言顺，世人齐力同心，情势渐渐好转起来。
南京留都，古称金陵，因战国楚威王熊商于石头城筑金陵邑，金陵之名源于此。又有秣陵、建业、建康等别称。自古便是江南富庶之地，特别太祖定都在此，更加集市昌隆，商贾云集。便是成祖北迁，南京还是作为留都，保持六部九卿、五军都督以及守备寺人的建制。与北京驿道、运河，来往便当。比及李闯围城，动静传到南京，一时纷繁扰扰，各地宗室、藩镇无不严峻谛视京师意向。
赵坤元马上成了南明朝廷的主心骨，拜为国师，统领百官，显赫非常。世人均谓其乃是姜尚再世、伊尹重生。然其内心非常不安，更加谨慎。因他自度非是济世安邦之才，办理朝政非其所长，不过仗着道法奥妙，又有宿世影象，故能事事预知。幸亏一帮文臣效命，武将亦不敢自专，局面也渐渐安定下来。
李、张民军也远不是清军敌手，纷繁败退。李自成于湖北九宫山死于暗箭，张献忠也俄然病死。明末义兵一时候没了领袖，多有降于满清者。其他部下纷繁四散。
一起上太子朱慈?r满腹忧愁，冷静无言。他毕竟是个十来岁的孩子，又善于深宫妇人之手，所教诲的教员多是一帮冬烘，能有多大见地？赵坤元思来想去，策画今后明室再兴还是要靠这小我的旗号，只得耐着性子，疏导于他。
不过坤兴公主倒是很有些宇量，先前见了木魃穆函猿猴般的表面，毫不镇静，便是断了一臂，面上也毫无忧色，只悄悄端坐一旁，听赵坤元二人叙话。公然不愧是今后能成为江湖驰名的独臂神尼。
汗青还是次第生长，吴三桂本想引清兵报仇，成果引狼入室，反为其所制，虽将李闯摈除出北京，却为满清趁虚而入，鹊巢鸠占。满蒙八旗势如破竹，一起上斩关夺将，不出数月淮河以北，大半边境为其兼并。吴三桂见清兵刁悍，无可抵敌，只得归降，作了千古汉奸。
赵坤元冷静点头，受了她三跪九叩的拜师大礼。
先前木魃穆函未与赵坤元一齐前去煤山，而是领了掌教号令，在城南运河四周觅得一艘官船，因赵坤元怕太子、公主二人孱羸，不堪高空罡气凛冽，故预先作此安排。等与穆函汇合，乃施法讳饰了形迹，沿着运河破浪而行。一起上遇着散落的宫人、婢女、官属，择其良善之辈选用在侧。
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诸人本已惶恐赵坤元、许飞娘等仙家道法，不敢他想。又有原总督京营寺人卢九德膜拜确认，对世人道：“奴婢提督京营时，常入内廷，就近与会太子，确是本人。且现有太子殿下教员大学士王铎在南京涵养，令其劈面见驾更无流言流言了！”
赵坤元又按着宿世的影象，将那一帮降清贰臣，渐次剥离关键权位，或以贪赃论罪，或以浮名斥逐，内里几个善能掌兵的，也峻厉警告，并派眼线时候监督。至于史可法、张慎言、高鸿图、姜曰广、刘宗周、徐石麒、瞿式耜等人天然信赖有加。还遍及网罗能臣干吏，于朝入耳用。一时候顿有复兴气象。
赵坤元虽担着国师之名，毕竟是个修道之人，怎能上阵杀敌？只不过用其名誉，邀制诸军，协同作战。他看重李岩帅才，故意命其统领各部军马，何如碍于他昔日身份，本来明军部将悉数反对，只得命史可法督师淮安，掌领中军，李岩所带领李张旧部，在上游驻扎；左良玉等部在蚌埠驰援。
赵坤元自有火有害等人来往通报军情，乃与南明君臣商讨，请其招降李、张旧部，赦免罪恶，将满蒙鞑虏驱除中原。朝中多有大臣反对，觉得李、张俱是君父死仇，无可宽恕。赵坤元几次劝说讲授，阐发短长，最后不得已又召来崇祯帝亡魂现身，乱哄哄搅闹多日，方才了局。乃由朱慈?r颁旨，大赦天下，号令合力抗清。
不一刻，半空剑啸声起，金红剑光闪映，落下二人，恰是先前去南京的许飞娘与火有害。诸人一齐到舱中叙话。
船行甚速，不一日便到了扬州邗沟，出了六圩渡口，又直奔白下，停在南都城外一处僻静的江岸，方才止住路程。
也是天意使然，赵坤元有些粗心，并未多想。哪知军情急转直下，俄然接到军报，淮河一线为清军所破，兵锋直逼扬州城下。顿时大惊失容，忙掐指一算，方明白后果结果，不由愤恨，切齿道：“想不到这帮贼子如此丧芥蒂狂，违逆天道。如此莫怪道爷亲身了局，将尔等打落深渊！”
当即君臣挥泪而别，各去安排，比及崇祯天子死讯传来，方筹办仪仗，到江岸将太子并公主一齐接到南都城内，简朴修整宫室，在武英殿即位。
先前李闯部将、制将军李岩，因为赵坤元提示，免于内部排挤，保存了性命，听到南明大赦天下的动静，乃纠集部将，率先投诚归顺。一时候南北诸多义兵纷至沓来，江北淮南之地，军兵糜集，几达百万之众。
朱慈?r按着赵坤元叮咛，来年改元隆武。或许是修习内野生气心法的原因，现在更加显得英姿勃勃，精力矍铄。又有赵坤元经常耳提面命，悉心指教，垂垂有了复兴之主的气势。当即宣旨，移驾浦口，安营而居，不着朝服，以孝服代之，时候筹办北伐中原，光复古帮。
赵坤元想成全于他，细心打量公主的根骨，半晌乃道：“公主殿下，贫道观你骨骼清奇，纯**体，乃是上佳的修道良才。贫道故意收你作个记名弟子，一来不孤负你这般根骨，二来修习道法，在太子殿下周边也可担负保护，共赴国难，不知意下如何？”
坤兴公主忙近前跪下道：“昔日宫中传闻有位护国真人，道法通玄，当时便有倾慕就教之心，可惜仙凡远隔，未曾得见，深觉得恨。奴虽生在帝王家，却厌倦尘凡，早有出世修行之念，因怕冲撞真人，不敢说出心中夙愿。现在真人金口亲开，怜我惨痛，弟子情愿拜在真人门下，伏请恩许！”
当即由许飞娘、火有害亲身来往飞翔，将留守南京四周的史可法、张慎言、高鸿图、姜曰广、刘宗周、徐石麒、瞿式耜及留守寺人韩赞周、卢九德等一班文武大臣，悉数接来。等世人齐到，方请朱慈?r升座，出示崇祯手书及玉玺诸物。
转眼到了来年，便是隆武元年，接到军情禀报，清兵移师南征，大肆南下。南明朝廷忙集结各部军马，设防淮河南岸。
清兵所占之地过于泛博，一时候感到兵力匮乏，也垂垂按住兵锋，与南明在淮河一线对峙。
赵坤元再三劝说，方止住了朱慈?r削发的动机。不过怕贰心中有怨，乃传他一套内野生气的心法，令其迟早勤奋，强建体格大有裨益。别的寻了僻静舱室，将一些上清入门的道法传授坤兴公主，又赐下几样护身的符咒，令其研习揣摩。
许飞娘禀道：“日前来至留都，拆看掌教锦囊，按计行事。至本日方才将几家文武大臣家宅拜访结束，将来意申明，或有思疑，然俱承诺到时太子亲临必往拜见，在南京继位，身等大宝，再行北伐，报此国仇家恨！”
得空赵坤元还命人找来夏允彝、夏完淳父子并陈子龙等人，甫一见面，夏、陈二人大惊，没想到这国师便是当年夏完淳满月宴席上游戏风尘的那位高人，不由感慨仙道并非迷茫，虔诚礼拜不已。赵坤元对三人鼓励一番，均委以重担，令在军中效力。
赵坤元嘲笑道：“王铎此人只写得一笔好字，可惜是贪恐怕死之辈，并非纯臣。本日在坐诸位俱是贫道采选忠义之士，事属奥妙，还需暗中安插，勿要张扬！”