同治十年（1871）仲春十五日，离马新贻刺杀的日期--清同治九年（1870）七月二十六日，整整过了半年以后，曾国藩奉旨监斩，在江宁小营法场将张文祥凌迟正法，并摘心致祭。马新贻四弟马新祐为了增加张文祥的痛苦，定制了一把刀、一把钩，交给刽子手作行刑之用。凌迟重刑，数十年可贵一见，有人说只“扎八刀”，有点脔割的意义就行了，有人说要用“鱼鳞剐”，一片片细切。而张文祥则是介乎其间，用定制的钩子紮住皮肉往上一拉，快刀割切，钩一下，割一下，自辰至未，方始完事。
最后一种传闻说，是江苏巡抚丁日昌花三千两银子打通张文祥，行刺了马新贻。
传闻说，张文祥曾经是湘军鲍超部下。鲍超是驰名的湘军将领，其部号称“霆字营”，为湘军主力，不过军纪废弛，常常公开打劫处所公众，号称“所过残灭如项羽”。张文祥插手霆字营后，因为作战英勇，遭到鲍超赏识，被汲引为新虎帐哨官。当时湘军内部时髦缔盟自保，很多人都是哥老会成员，霆字营也有哥老会构造，张文祥插手了哥老会，并成为一个小头子。
有关此案的小说两种。一是平江不肖生的《刺马详情》选自他的名著《江湖奇侠传》。据平江不肖生说，他对本案的详情，是从郑敦谨的半子口中所得。而郑敦谨的半子，则在郑敦谨鞠问张文祥时，在屏风前面偷听到的。其实在程度如何，不得而知，但读来娓娓动听，合情公道。读者不但能够借以晓得刺马案的详情，还可同时晓得火烧红莲寺的来龙去脉，真是一举两得。
张文祥又一向几次在翻供，见着谁咬谁，审理案件的人又不敢用大刑，毕竟这事已经捅破了天，搞得全天下的人都晓得了，上面又不断的在催问，是想弄清楚，也不想弄清楚，最后不得不草草结案，至于最后，大师谁都不晓得谁是幕后的真凶，此案就那么不了了之。
江苏巡抚为两江总督部属，统领姑苏、松江、常州、镇江四府和太仓直隶州，驻在姑苏。之前，太湖海军哨勇徐有得、刘步标伴随哨官王有明到姑苏看病。当晚，徐有得、刘步标二人闲逛倡寮，刚好碰到丁日昌族人都司丁炳、范贵等人。两边因为争夺一名仙颜妓女起了抵触，打起架来。刚好姑苏亲虎帐游击薛荫榜带兵巡夜，将惹事的两边都抓了起来，各打四十军棍，以示鉴戒。恰好徐有得很不平气，成果又被加打了四十军棍。
刺马案的第三种说法和湘军有关，毕竟马新贻是被派去彻查湘军中饱私囊承平天国财产的，马新贻在江宁期间，天然让那些战后留在本地、手上把握大笔财产的原湘军退伍甲士战战兢兢不已。这一旦查出来，但是杀头的大罪。
四十天后，马新贻遇刺。最可疑的是，马新贻遇刺当天的阅射，遵还是例总督和巡抚都要插手，但江苏巡抚丁日昌却并未参加。他已经在刺马案产生前夕自姑苏赶赴天津。不过，丁日昌赶赴天津倒是奉旨所为。当时，曾国藩措置天津教案不力，被天下高低痛骂，曾国藩感到难以支撑，便上奏要求另派大臣赴津协同办案。因而清廷选中了有“洋务能员”之称的江苏巡抚丁日昌。六月二十八日，清廷下谕令命江苏巡抚丁日昌赴津办理教案，因其路远，难以速至，又命工部尚书毛昶熙先赴天津。
曾国藩措置天津教案，实在是挺公道的，但当时那种汉人到处被洋人逼迫的氛围之下，一代重臣也只能沦为了炮灰，为本身光辉的经历表上留下了一记败笔。
因为丁蕙蘅拒不到案，此案拖了将近一年也没法结案。马新贻非常愤怒，决定强行结案，将丁炳、薛荫榜、丁蕙蘅、丁继祖等人都处以撤职，并判出款一万两白银以安设死者。丁蕙蘅仗着父亲是江苏巡抚，对峙不肯归案，马新贻也有体例措置，上奏请交朝廷议处。
另一种是佚名著《张文祥刺马》，所述与平江不肖生的大同小异。两个故事和这个版本的很类似。
另有一种说法是，马新贻是被洋人买凶杀死的。传闻说，马新贻在上海与小刀会作战时受了伤，在董家渡病院医治时受洗插手了上帝教。他上任两江总督后，与法国上帝教江南教区的主教郎怀仁来往密切，干系极其特别。安庆教案产生后，法国驻华公使罗淑亚到江宁同马新贻谈判，马新贻对罗淑亚极其友爱，统统照法国人的要求办理。过后，马新贻与安徽巡抚英翰联衔发书记示，死力鼓吹上帝教的善行，劝人保护外教，并勒石竖碑保卫上帝教。马新贻又派兵庇护在江宁等地的上帝教堂。同治九年（1870），江宁产生反洋教活动，构造者是提督陈国瑞。陈国瑞还获得了江苏布政使梅启照的暗中支撑，帮忙印刷了大量鼓吹布羽士残杀中国小童的质料。马新贻晓得后非常活力，派兵缉捕陈国瑞。陈国瑞逃离江宁，经扬州到天津，插手了反洋教的活动，并获得了醇亲王奕的支撑。天津教案产生后，法国布羽士及驻华公使公开以武力威胁，要求惩办陈国瑞，但因为醇亲王的庇护，被军机处对付畴昔。马新贻被刺杀后，布羽士反应激烈，镇江城里的布羽士还公开为他搞记念活动。刚好张文祥供词中有“养兵千日，用兵一时”的说法，又因为如没有外线指引，张文祥底子就没法进入马新贻由校场回署的箭道，不成能在光天化日之下、在刀枪林立当中，一刀杀了两江总督大人。因而，江宁城中又传播着是醇亲王奕和陈国瑞教唆张文祥刺杀了马新贻。而更加古怪的是，陈国瑞厥后被发往黑龙江齐齐哈尔当差，于光绪八年古怪死于黑龙江戍所，风传他是被人杀死。
刺马案遭到连累的另有很多人。张文祥的儿子张长福时年十二岁，也遭到连累，被阉割后发往新疆为奴。其女张宝珍、张秀珍因许嫁已定，并不知情，各归本夫。督标中军副将喻吉三因疏于防护，被革去提督衔，降二级调用。把总唐得金等人均因渎职罪名被斥革。
不料四天后，徐有得伤重而死，事情一下子就闹大了。江苏巡抚丁日昌为了表示本身公道，主动上奏，自请议处。此时他还不晓得当天早晨在倡寮参与打斗的另有本身的儿子丁蕙蘅（时为候补道员）和侄子丁继祖，厥后晓得事情经过后，悔怨莫及，但也无可何如。
奇特的是，丁日昌接到谕令后，没有当即赶赴天津，而是一向拖到七月十四日。当时，从姑苏达到天津需求十天摆布，也就是说，丁日昌是在马新贻遇刺前十天就分开了姑苏，并且刚幸亏刺马案产生的前一天——也就是七月二十五日达到了天津。一下船，丁日昌便直奔直隶督署，与曾国藩密谈很久。恰是在当天，江宁大雨，马新贻阅射未能成行。
刺马案久审不能结案，刺客供词闪动，主审官员含混其辞，前后审案官员多达五十余人，每次奏结均疑点重重，没法自圆其说。以是一时流言纷繁，各种传闻迭起，飞短流长，更使得案情扑朔迷离。当年袁世凯年仅十五岁，竟然也非常猎奇地去处参与会审的嗣父袁保庆（本为袁世凯叔父，袁世凯被过继给他为子）探听。
1870年（同治九年）4、5月间，天津产生多起儿童失落绑架的事件。6月初，气候酷热，疫病风行，育婴堂中有3、四十名孤儿得病而死，每天稀有百人到坟地围观，挖出孩子的尸身检察。因而官方开端传言“本国修女以育婴堂为晃子，实则绑架杀死孩童作为药材之用”等荒诞谎言。
湘军前期，霆字营受哥老会煽动，在湖北金口闹饷，产生叛变。张文祥趁乱逃到天目山，躲进一座寺庙里。刚好寺庙长老是六合会首级，以削发人的身份做保护，批示山下的六合会处置反清复明的活动。张文祥晓得本相后，插手了六合会。厥后马新贻任浙江巡抚，在宁波、台州大肆“剿匪”，捕杀了很多六合会成员。寺庙长老非常痛心，便拜托张文祥杀马新贻为六合会会友报仇。
哥老会是基层大众自发结成的社会群体，是官方奥妙结社。有关哥老会的源流题目，是耐久困扰汗青学事情者的一个难明之谜。究其启事，与六合会发源题目类似。其一，哥老会是基层大众的自发连络构造。不必然有精确的建立时候，建立时也不会留下可靠的质料；其二是辛亥反动时，反动党报酬了联络和指导哥老会，大力鼓吹哥老会乃承平天国李秀成、李世贤等派洪门中人潜入湘军而创建；其三，晚清及民国年间，洪门、青帮与哥老会相互渗入与融会，一些帮会中人便极力鼓吹洪门、汉留(哥老会)源出一家，皆为郑胜利初创之说，莫非是为了反清复明？
第二天，七月二十六日上午，身在江宁的马新贻被张文祥刺杀于回府衙的路上的时候，在天津，曾国藩正赶去回访丁日昌，奥妙扳谈了近一天。
刺马案后，丁日昌一向滞留在天津，直到朝廷让曾国藩回任两江总督的上谕达到。当时曾国藩措置天津教案不当，“残民媚外”，备受中外抨击，回任两江总督能够将他从泥潭中拉出来，绝对是一件功德。但曾国藩与亲信几次商讨后，决定以身材多病为来由，固辞两江总督。不料朝廷的态度非常果断，有病也必须去两江。
鲍超（1828年—1886年），初字春亭，后改春霆，夔州安坪藕塘（今重庆奉节）人，清朝晚期湘军闻名将领，绝对是百战百胜的兵王。
哥老会，发源于湖南和湖北，是近代中国活泼于长江流域，阵容和影响都很大的一个奥妙结社构造。在四川和重庆的哥老会被称为袍哥。
第三天下午，马新贻因伤势太重而死时，曾国藩正在昼寝，还在日记中记录当时的表情是“心不能静”。丁日昌随后赶到直隶督署，二人又是一番密谈，直到深夜。
在残暴的处刑过程中，张文祥始终未出一言，视死如归，很有豪杰气势。他的名字却在史籍中被决计改成“张汶祥”，“文”字加水，表示其江洋悍贼的身份，有鄙弃他的意义。
回到刺马案上来，日复一日，刺马案的眉目也越来越多，盘根错节，牵涉太广。仅以上五种传闻，就牵涉上了回王、湘军、六合会、洋教士、陈国瑞、醇亲王以及丁日昌。
1870年6月20日，一名被住民扭送官府的强盗武兰珍供词中又连累到教民王三及望海楼上帝堂。因而民情激愤，士绅集会，书院停课，反洋教情感高涨。第二天凌晨，天津知县刘杰带人犯武兰珍去教堂对证，发明该堂并无王三其人，也没有武兰珍所供的席棚栅栏，“遍传堂中之人，该犯并不熟谙，无从指证”。故证明，觉得对教堂和仁慈堂的曲解曲解，但此时大众已经无从辩白真假。
行伍出身。先从茂发赴广西弹压承平天国活动，后调充湘军海军哨长。前后战岳州、武昌、金口，赐号“壮勇巴图鲁”、官记名海军总兵。咸丰六年（1856年）募湘勇创建霆字五营，改领陆军。转战湖北、安徽、江西、浙江、广东、河南、陕西各地，再赐“博通额巴图鲁”名号，历官湖南绥靖镇总兵至浙江提督，封一等子爵加一云骑尉世职。同治六年（1867年）率部赴陕西弹压捻军，在安陆之战中被劾误期，去官。光绪六年（1880年）起任湖南提督，再募军驻直隶乐亭防备俄国。光绪十年（1884年），中法战役发作，率部驻防云南白马关外备战。鲍超平生插手过500场以上战役，身被伤108处。光绪十二年（1886年）去世，谥忠壮。
朝廷将案件交给了两江总督马新贻措置。马新贻接案后，倒也非常当真地秉公措置，但丁蕙蘅始终不肯来江宁投案，派人前去传唤，丁日昌则推托说儿半夜里越墙窜匿，不知去处。而实际上，很多人亲目睹到丁蕙蘅在巡抚衙门进收支出，毫无顾忌。这期间，丁日昌多次向马新贻拜托，但愿他高抬贵手。马新贻摆官架子，以为丁蕙蘅拒不投案是用心鄙视本身，又因丁日昌是曾国藩亲信，非常警戒，置之不睬。